高加索犬是中亚吗？
先上结论，高加索牧羊犬不是中亚牧羊犬。 两种狗的渊源极深，人们经常将两者弄混。在搜索引擎中输入“高加索”或者“中亚”时，很多内容会标题党为“高加索就是中亚”。但经过研究，我们可以发现两者的起源和外形特征有着明显的不同（图1）。 我们通过分析基因序列判断两种狗的分化时间。结果表明，现在饲养的高加索与中亚在500年前就已经完全分化了。[1] 表1 中国常见品种的犬DNA测序结果 注：A、B分别代表雄性、雌性；C~F分别为中华田园犬、西藏獒犬、松狮犬和高加索。 *N表示未测序。 图1 中亚和高加索的外貌对比 上图中是两种狗各选3只代表性的狗狗图片（幼犬），从外貌上来看，高加索明显更大更凶猛一些，而中亚则是细腰细腿，相对要苗条许多。
为了进一步研究它们的区别，我们分析了92头不同地区的狗（包括高加索和欧亚大陆西部的各种狗）的全基因组测序数据。结果发现，这些狗共包含约4亿个单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism， SNPs)，可以用来区分不同狗个体。利用这些信息，我们就可以像指纹鉴定了人类DNA一样给每一只狗一个独特的遗传代码，从而精确地追溯它们各自的祖先。 基于全基因组数据，我们发现，虽然高加索和中亚都属于大型犬，但是它们的祖先在数千年以前就分道扬镳了 (图2) 。
我们还在整个基因组范围内寻找可能与这两种犬的生理特性相关的基因。找到了几个有趣的基因，其中一个是控制肌肉生长相关蛋白的基因MYH7，另一个是影响葡萄糖代谢的基因KCNJ11。这两个基因的突变都可以导致肌肉含量偏低和胰岛素耐受增加，可能是造成这两种狗不同食物需求（肉类比例高或者低）以及血糖水平和胰岛素水平差异的原因。另外，我们还发现了几个与免疫系统相关基因的变化，有可能造成了这种狗易得真菌感染的特性。
综上，我们的结果清晰展示了中亚和高加索的分化历程，而且也找到了可能影响到这两种狗独特性状基因。虽然这些基因的研究还需要进一步验证，但是如果能证明这些基因在狗特定品种形成的过程中起作用，那么就可以解释为什么高加索和中亚今天能够拥有如此截然不同的特性了。